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covid-19在医院映射的扩展为“打破链”传输的

2020年10月7日

第一-性高的临床试验,在伦敦大学学院的科学家领导,将评估使用的“实时”病毒的基因组数据,以减少covid-19的医院内传播。

‘real time’ viral genomic data could help reduce the spread of COVID-19 in hospitals

这项研究的结果可以帮助NHS通过确定减少病毒的进一步传播,如果一个人在同一家医院内的其他人员抓住了病毒。

庭审中,通过教授朱迪思·布鲁尔,UCL / UCLH /天哪生物医学研究中心资助的病原体基因组学单位(PGU / UCLG)的董事,与UCL全面的临床试验单元(cctu),政府2000万£covid的形式部分一起带领-19基因组学英国财团(COG-UK) - 这已经建立了英国各地的快速基因组测序中心组成的网络 - 让科学家绘制全国各地的病毒的传播。

解释试验的重要性,教授布鲁尔,在利用基因组学追踪医院感染的专家说:“在医院covid-19感染的蔓延,现在认为是两个医务人员和患者的一大难题,而“破这些传输的链是至关重要的。

“尝试和测试程序,以减少医院感染的传播已经投入使用,其中包括covid-19感染的病人未感染的患者,彻底的清洗,使用个人防护装备,并不断洗手分离。

“尽管有这些措施,covid-19传输给病人和工作人员仍在发生,并已黯然证明是致命的。因此,我们尝试新的工具,如病毒测序,找出为什么发生这种情况,并帮助降低医院传播是至关重要的。” 

这一研究领域的重要性已被国家卫生研究所(NIHR)的认可。这项研究是一个数字covid-19的研究已经由健康和社会保健部门给予紧迫的公共卫生研究现状之一。

在COG-UK医院发病covid-19感染(HOCI)试验已开发与NIHR UCL / UCLH BRC支持病原体基因组学在伦敦大学学院与帝国学院卫生保健信托协作单位,谢菲尔德教学医院NHS与谢菲尔德大学的基础信任,与格拉斯哥中心的MRC-大学病毒研究的格拉斯哥皇家医院。 COG-UK HOCI将涉及超过15家医院挂英国各地的COG-UK测序中心。

每个站点将分析鼻腔和咽喉样本中covid-19序列与所有已知covid,19例在医院里,新近感染住院病人及一线NHS工作人员。试验将评估所有covid-19样品(现在24-48小时内可用)的全病毒基因组测序结果是否减少与标准的方法相比,医院暴发的数目。具体而言,基因组数据很可能使在各医院的临床团队,看看新感染的病人从一个已知的正covid-19的患者在医院内拿起病毒,或从外院。

已经有证据COG-UK新兴covid-19序列可以帮助团队控制医院感染的更好。在COG-UK HOCI试验将通过多测序如何帮助,是多么重要快速返回结果,什么是实现跨越NHS covid-19测序的最佳方式,多少它的成本量化。这些信息将有助于使更精确的计划,至于如何在未来使用covid-19测序。

增加教授布鲁尔说:“我们已经知道,比较字母组成与来信covid-19的另一个样本中的序列中的一个covid-19病毒基因序列,可以告诉我们,这两种病毒是否相同或不同。

“因此,通过测序covid-19病毒迅速,我们希望建立医务人员和病人如何受到感染。这将允许医院采取有效措施到位快,要尽量阻止该病毒的向前传输,减少暴发的数量和规模。这些措施可能包括更多的定期深层清洁,检查和反复检查的PPE设备的效率,并且完全移动等弱势患者从医院出来到另一个设置“。

covid-19病毒密切相关(传输从一个病人到另一个或医护人员)都会有相同的序列,而由具有不同序列将排除之间covid-19传输的可能性,两个人covid-19病毒患者或医护人员。   

教授艾莉森·霍姆斯,在医疗保健相关的感染和耐药性的NIHR卫生防护研究部主管,设在伦敦帝国学院,说:“认识和预防医院的发病covid-19感染将是任何恢复策略的一个重要方面医院。

“建立感染的预防方法和监督办法用来跟踪和追踪感染及耐药性将被应用,但现在通过基因指纹提供的额外信息的支持。”

在COG-UK项目是由NHS,公共卫生机构和学术机构 - 包括UCL和UCLH - 和将提供covid-19的大规模测序,并与医院,地区NHS中心和政府情报共享。从患者的COG-UK样品的确诊病例covid-19被送往测序中心遍布英国的网络。

增加教授布鲁尔:“使用病毒基因组学,我们现在可以跟踪covid-19差的医院,以及在国内和国际的设置如何。我们的试验将有望为医院的有价值的信息涉及泄露必须为了停下来控制covid-19传播链。”

下面的NHS已证实,他们正在参与HOCI试验:

  • 帝国理工学院医疗保健NHS信托
  • 谢菲尔德教学医院NHS信托基金会
  • NHS格拉斯哥和克莱德更大
  • NHS洛锡安
  • 家伙和圣托马斯NHS信托基金会
  • 曼彻斯特大学NHS信托基金会
  • 英国伦敦大学学院医院NHS信托基金会
  • 皇家自由伦敦NHS信托基金会
  • 大学医院南安普敦NHS信托基金会
  • 纽卡斯尔医院NHS信托基金会
  • Royal Devon & Exeter NHS Foundation Trust
  • 诺福克和诺威奇大学医院NHS信托基金会
  • 利物浦大学医院NHS信托基金会
  • 利兹教学医院NHS信托

UCL是在讨论有关参与试验的另外六个NHS信托。

链接

图片

  • 信用哈维尔matheu上 unsplash 立方厘米2.0  

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